Comenius üniversitesi, slovakya'nın en büyük üniversitesidir, çoğu fakültesi bratislava'da yer almaktadır. 1919 yılın'da kurulan üniversite ismini 17. yüzyıl'da yaşamış filozof ve öğretmen Jan Amos Comenius'dan almaktadır.

Comenius üniversitesi 30.000'den fazla öğrenci ve 2000'den fazla fakülte görevlisi ile faaliyet göstermektedir.

Fakülteler

• Tıp Fakültesi
• Hukuk Fakültesi
• Psikoloji Fakültesi
• Doğa Bilimleri Fakültesi
• Eğitim Fakültesi
• Eczacılık Fakültesi
• Beden Eğitim ve Spor Fakültesi
• Matematik, Fizik, İnformatik Fakültesi
• İşletme Fakültesi
• Sosyal Bilimler ve Ekonomi Fakültesi

 Önemli Mezunlar

• Matt Blasko - current manager of the renowned SMIF equity fund
• Emil Benčík - journalist and translator
• Zuzana Beňušková - ethnologist
• József Berényi - Chairman of the Party of the Hungarian Coalition
• Robert Fico - current Prime minister of Slovakia
• Rudolf Macúch - Protestant theologian and expert on Mandaean language and Samaritan language
• Zora Mintalová - Zubercová - ethnographer, historian and museologist
• Milan Mišík - geologist and university professor
• Vladimír Palko - former Interior minister of Slovakia
• Ladislav Pataki – sports scientist, athletics coach, masters athletics champion
• Tomáš Raček - actor and diplomat
• Iveta Radičová - former Prime minister of Slovakia
• Daniel Šmihula - lawyer, political scientist and journalist
• Ernest Valko - assassinated constitutional lawyer
• Ján Vilček - biomedical scientist, educator, inventor and philanthropist
• Štefan Znám - mathematician, first to ponder Znám's problem in modern mathematics